近日,美国 华盛顿大学(University of Washington)Samuel Berhanu,Sagardip Majumder等,在Science上发文,报道了一种通用的方法,以设计具有不同直径和孔几何形状的跨膜β-桶孔。
核磁共振和晶体学表征表明,设计是稳定折叠的,具有与设计模型相似的结构。这些设计具有与孔径相关的不同电导,范围从110微微西门子picosiemens(~0.5纳米孔径)到430微微西门子(~1.1纳米孔径)。这一方法,可助力传感和测序应用的跨膜纳米孔定制设计。
Sculpting conducting nanopore size and shape through de novo protein design.
图3. 实验确定的纳米孔结构与计算设计紧密一致特性。
β-桶蛋白barrel proteins结构简单,但对离子和小分子的正确折叠和跨膜传导,却有复杂的要求。
该项研究,开发了一种设计方法,从而产生了具有一系列跨膜链,以及从椭圆形到正方形到三角形几何形状的β-桶蛋白。在二级结构中,加入断裂breaks,以防止聚集并促进折叠成膜。研究表明,这些蛋白质传导离子,并具有有利于传感应用的特性。
文献链接
Samuel Berhanu et al. , Sculpting conducting nanopore size and shape through de novo protein design. Science 385, 282-288 (2024).
DOI:10.1126/science.adn3796
https://www.science.org/doi/10.1126/science.adn3796
本文译自Science。
评论
加载更多